課程資訊
課程名稱
基因體研究論著選讀
Genomic Study Seminar 
開課學期
104-2 
授課對象
醫學院  生理學研究所  
授課教師
賴亮全 
課號
Physio7017 
課程識別碼
441 M3400 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二7,8(14:20~16:20) 
上課地點
基醫1003 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。
總人數上限:25人
外系人數限制:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1042Physio7017 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程內容如下:
*Introduction: brief history of genetics
*Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques
-- In-house spotted arrays
-- Prespotted array (inkjet print)
-- Photolithograph
-- Maskless array synthesis
-- BeadChip
-- MicroArray Quality Control (MAQC) Project

*Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques
-- RT-PCR

*Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques
-- Next generation sequencing

*Genomic approaches to study:
-- Gene expression profiling
-- Single nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), loss of heterozygosity (LOH)
-- DNA-protein interaction
-- Epigenomic: DNA Methylation
-- Epigenomic: noncoding RNA

 

課程目標
本課程主旨在透過期刊論文的研讀以及討論,使同學瞭解基因體技術在生物學上的應用及最新發展趨勢。 
課程要求
不遲到早退, 積極參與課堂間的報告與討論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
上課講義
 
參考書目
無 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席狀況與課堂參與 
10% 
 
2. 
期末書面報告 
20% 
 
3. 
期末口頭報告 
20% 
 
4. 
期中考 
50% 
期中考筆試 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/23  Introduction: brief history of genetics/Human Genome Project 
第2週
3/1  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第3週
3/8  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第4週
3/15  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques; PCR-based techniques 
第5週
3/22  Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques; Sequence-based techniques 
第6週
3/29  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第7週
4/5  Spring break 
第8週
4/12  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第9週
4/19  Break (AACR meeting) 
第10週
4/26  Mid-term Examination 
第11週
5/3  Genomic approaches to study gene expression 
第12週
5/10  Genomic approaches to study chromosomal aberration 
第13週
5/17  Genomic approaches to study DNA Methylation 
第14週
5/24  Genomic approaches to study non-coding RNA 
第15週
5/31  Genomic approaches to study DNA-protein interaction 
第16週
6/7  Final Project Presentation 
第17週
6/14  Final Project Presentation